מרכז ההכוון של שק"ל הוא מסלול להכוון, אבחון והשמה תעסוקתית לאנשים עם אוטיזם בתפקוד גבוה, המיועד לאנשים שרוצים ויכולים לעבוד באופן עצמאי בשוק החופשי. מטרת המסלול הוא הכנה לעולם העבודה המשתנה, פיתוח מיומנויות חברתיות, תקשורתיות ותעסוקתיות, שילוב והשמה הולמים בשוק החופשי, וכל זאת תוך מתן מעטפת אישית לכל משתתף, הקניית תחושות ביטחון, הצלחה ומסוגלות, וליווי ותמיכה צמודים לאורך כל הדרך.
תכנית הלימודים במסלול נפרסת על פני חצי שנה וכוללת בין השאר סדנת תוכן מבוססת I PRO - מודל הכשרה לעולם העבודה המשתנה, התנסות תעסוקתית במגוון תפקידים ומקומות עבודה, סיורים ותצפיות במקומות עבודה ותפקידים מייצגים, תגבורים לימודיים, קורס מחשבים ואוריינות דיגיטלית וקורסי בחירה שונים נוספים.
מנכ"ל שק"ל, עופר דהרי: "שק"ל מחוללת מהפכה בשילוב תעסוקתי של אנשים עם מוגבלות בשנים האחרונות. אנו שוברים חומות ומחסומים כדי להמשיך ולעצב את עולם העבודה המודרני לקבל ולהכיל את הכישרון והפוטנציאל האינסופיים הטמונים באנשים עם מוגבלות. כל הישג וכל סיפור הצלחה במרכז שלנו מוכיחים לנו שכאשר ניתנת להם ההזדמנות, אנשים עם מוגבלות לא רק משתלבים בעבודה - הם מצטיינים בעבודתם".